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Thaís
Dolzany

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Translacional

Oncologia & Bioinformática

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Sobre mim

Thaís Dolzany

Farmacêutica e pesquisadora em oncologia translacional

Sou farmacêutica, com doutorado em Bioquímica pela Universidade de Colônia, na Alemanha, onde estudei vesículas extracelulares e a sinalização da quinase Lyn na leucemia linfocítica crônica. No mestrado, trabalhei com nanopartículas de PLGA funcionalizadas com peptídeos. Hoje trabalho com transcriptômica single-cell e bulk, priorização de alvos e reposicionamento de fármacos em câncer, usando dados públicos e código que outras pessoas conseguem rodar de novo.

Também sou Farmacêutica Responsável e Líder de Assuntos Médicos e Científicos em uma empresa farmacêutica em São Paulo, e sou docente do curso de Farmácia da Afya Universidade Unigranrio.

  • 10+anos de pesquisa
  • 5publicações
  • PhDUniversität zu Köln
  • R
  • Python
  • Seurat
  • Scanpy
  • Harmony
  • pySCENIC
  • DESeq2
  • GSEA
  • pandas
  • RDKit
  • XGBoost
  • scikit-learn
  • Nextflow
  • BWA
  • samtools
  • bcftools
  • MultiQC
  • Docker
  • GitHub Actions
  • Git
  • GEO
  • TCGA
  • cBioPortal
  • ClinicalTrials.gov

Projetos selecionados

UMAP de células de melanoma coloridas por tipo celular
Melanoma · scRNA-seq · Imunoterapia

Programa de resistência maligna & exclusão de células T

7.186 células de 31 tumores (GSE115978). Com tumores, e não células, como réplicas, só 61 dos 5.384 genes significativos no nível celular se mantêm; a perda de EMP1 após o tratamento é o sinal mais forte que resta.

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Mapa do Brasil colorido pelo número de estudos clínicos em oncologia com centro em cada estado
Operações clínicas · Python · API

Estudos clínicos em oncologia com centros no Brasil

1.908 estudos intervencionais e 11.387 centros brasileiros do ClinicalTrials.gov. 72% são patrocinados pela indústria e 73% são multinacionais: uma visão de viabilidade por fase, tipo de tumor e estado.

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Solubilidade aquosa prevista versus observada em uma divisão por scaffold
ADME · Quimioinformática · Machine learning

Predição de solubilidade com mudança de scaffold

9.145 moléculas curadas (AqSolDB). O XGBoost chega a RMSE 0,85 em divisão aleatória, mas 1,23 unidades log em scaffolds nunca vistos, e o erro cresce à medida que a similaridade com o conjunto de treino diminui.

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Nextflow · CI
Validado
NGS · Nextflow · Variantes germinativas

ngs-germline-panel-nf

Pipeline Nextflow para painéis de genes: controle de qualidade, alinhamento, cobertura por alvo, chamada e anotação de variantes. Validado contra um truth set a cada push: 131 de 132 variantes recuperadas, e a única perdida aparece sinalizada como baixa cobertura.

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16 GB
Scanpy · Harmony · pySCENIC

scanpy-lowmem

Padrões e patches para integrar ~486 mil células em um notebook de 16 GB, com testes e um benchmark de memória: o PCA esparso centralizado usa menos de 200 MB extras, menos que o atalho sem centralizar.

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GEO · cBioPortal · GDC
Python · Dados públicos

omics-fetch

Scripts de download para GEO, cBioPortal e TCGA que conferem o tamanho dos arquivos, registram checksums e relatam falhas. Coberto por 18 testes.

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Plaqueamento
Online
Bancada · HTML · Sem dependências

Calculadora de plaqueamento

Ferramenta de bancada que transforma uma suspensão celular contada em uma receita de master mix para placas e garrafas. Bilíngue, com fórmulas testadas.

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Experiência & formação

Farmacêutica Responsável · Líder de Assuntos Médicos e Científicos

Medra Brasil · São Paulo

Responsabilidade técnica, assuntos regulatórios e conteúdo científico para uma empresa farmacêutica.

Docente universitária · Farmácia

Afya Universidade Unigranrio

Docente do curso de Farmácia EAD e membro do Núcleo Docente Estruturante (NDE) dos cursos presencial e EAD.

Colaboração em pesquisa

LABEC · Universidade de Mogi das Cruzes

Projetos de oncologia computacional e reposicionamento de fármacos.

Pesquisadora de doutorado

Universität zu Köln · Alemanha

Vesículas extracelulares e sinalização da quinase Lyn na leucemia linfocítica crônica.

Doutorado em Bioquímica

Universität zu Köln · Alemanha

Diploma revalidado no Brasil pela UFRGS.

Mestrado em Biotecnologia

Universidade de Mogi das Cruzes

Nanopartículas de PLGA e peptídeos para liberação de fármacos.

Especializações

Farmacologia · Assuntos Regulatórios na Indústria Farmacêutica

Graduação em Farmácia

Farmacêutica registrada no CRF-SP

No que eu trabalho

Controle de qualidade, integração de atlas multicoorte, clusterização e anotação, estados celulares malignos, inferência de regulons e expressão diferencial, com Seurat, Scanpy, Harmony, pySCENIC e DESeq2.

Conexão entre programas de expressão, alvos druggable e compostos existentes, usando assinaturas de perturbação, screens de dependência e redes de interação.

Análises de registros de estudos clínicos para viabilidade, assuntos médicos e trabalho regulatório junto à ANVISA.

Experiência de bancada em biologia de vesículas extracelulares, sinalização de quinases em leucemia e nanopartículas poliméricas.

Publicações

Vamos conversar

Aberta a colaborações em oncologia computacional, posições de pós-doutorado e funções de pesquisa translacional na indústria.